施用化肥會(huì)造成污染，使地力下降，加重水土流失和增加能量消耗。但施化肥對(duì)于永久性的果樹來(lái)說(shuō)是必需的，因果樹吸收的礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)元素都必須是無(wú)機(jī)形態(tài)時(shí)方能為果樹利用。植物吸收這些營(yíng)養(yǎng)元素后通過(guò)光合作用形成各種有機(jī)物，供動(dòng)物和人類利用。所剩余的有機(jī)質(zhì)也必須通過(guò)腐生生物分解為無(wú)機(jī)形態(tài)后，方可被果樹吸收利用。
    當(dāng)有機(jī)質(zhì)分解形成的礦質(zhì)元素和來(lái)自巖石土壤、空氣、雨水的礦質(zhì)元素不能滿足果樹不斷提高單位面積產(chǎn)量和質(zhì)量需要時(shí)，合理增施化肥是完全符合自然規(guī)律的仿生栽培措施。這種措施基礎(chǔ)一旦失去就會(huì)使果樹生長(zhǎng)失調(diào)，最終導(dǎo)致果樹減產(chǎn)降質(zhì)。土壤板結(jié)，土壤沖刷加劇的現(xiàn)象，并非完全因施用化肥引起，而主要是由于使用化肥后減少或不施有機(jī)肥以及灌溉不當(dāng)所造成。在有機(jī)質(zhì)充分歸還土壤的前提下，即使長(zhǎng)期施用化肥也不會(huì)因破壞土壤結(jié)構(gòu)，而加劇水土流失。
    關(guān)于化肥施用后造成土壤環(huán)境污染的問題，其一是某些元素施用過(guò)量，如硝態(tài)氮過(guò)量施用就會(huì)產(chǎn)生NO2-，這可以從減少過(guò)量施用或者通過(guò)改善土壤結(jié)構(gòu)加以調(diào)節(jié)解決。其二是在化肥生產(chǎn)中盡量減少有毒物雜質(zhì)，如化肥中的鎘等有毒物質(zhì)，需要在制造中消除。在化肥的施用中，特別是氮肥，能量消耗多，這可通過(guò)利用菌肥來(lái)減少化肥用量，從而得以解決。

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