為了獲得更高的產(chǎn)量，人類在農(nóng)田里連續(xù)和大量使用了化肥和農(nóng)藥。農(nóng)田土壤中的有機質(zhì)匱乏，微生物種類和數(shù)量大大減少了，其中也包括一些能夠抑制土傳病害的有益微生物，如放線菌、木霉菌、芽胞桿菌等。

另一方面，許多危害植物的病菌在病殘體中更容易越冬。如果土壤中缺少腐生細菌，植株秸稈不能很快腐爛，病菌也就有了更多的存活機會。也正因為以上原因，近來枯萎病、紋枯病、根腐病、立枯病等日益猖獗。

針對土傳病害日益嚴重的問題可以采取兩種策略。一是繼續(xù)加強化學或物理的殺滅措施，盡可能給作物創(chuàng)造一種無菌的條件。這是比較難的，因為土壤的結(jié)構(gòu)和理化特性比較復(fù)雜，有許多因素影響滅菌效果；即便暫時能夠做到，但一旦有新的病菌進入，由于缺乏自然抑制能力，就會迅速成災(zāi)。

另一種策略是增加農(nóng)田土壤微生物種類和數(shù)量，創(chuàng)造一個合理、平衡、穩(wěn)定的微生物區(qū)系并依靠他們之間的競爭、占位、重寄生等關(guān)系，抑制病菌的滋長。實踐證明這是持續(xù)防治病害的合理策略。
實現(xiàn)生態(tài)平衡，抑制土傳病害，一方面需要不斷增加土壤有機質(zhì)，包括農(nóng)家肥（廄肥、堆肥）、工廠化生產(chǎn)的有機肥、秸稈還田和種植草苜蓿等綠肥作物。有機質(zhì)不僅蘊涵豐富的營養(yǎng)物質(zhì)，使土壤形成團粒結(jié)構(gòu)，還是培養(yǎng)各種微生物的基質(zhì)。

另一方面要增加有益微生物的種類和數(shù)量，也就是施用一定數(shù)量的菌肥。菌肥也稱生物肥料、細菌肥料。確切地說，它們是菌而不是肥，主要成分不是營養(yǎng)元素，而是大量的微生物。

它的功效在于通過微生物的活動，改善作物的營養(yǎng)條件并分解土壤中的有機質(zhì)，使他們變成能夠被植物吸收的營養(yǎng)，這就如同人吃的飯菜必須經(jīng)過消化才能被吸收一樣。秸稈還田后如果沒有微生物的幫助，不僅不能被植物利用，還可能助長病菌的滋生；

另一方面，再好、再多的菌肥撒在貧瘠的土壤中也不可能憑空轉(zhuǎn)換出營養(yǎng)元素，有益微生物也會餓死。只有當有機物與有益微生物同時存在時，才能起到增肥防病的效果。
一種按適當比例在大量有機物質(zhì)中植入有益微生物的新型多效有機肥，其微生物包括能夠增加或轉(zhuǎn)化營養(yǎng)的固氮菌、硝酸菌、溶磷菌、光合菌；能夠分解有機質(zhì)的酵母菌；能夠分泌植物生長刺激素和抑制病菌的哈刺木霉、綠粘帚霉、放線菌以及一些芽胞桿菌和假單胞菌。

該肥種具有長效、速效、增產(chǎn)防病的優(yōu)點，值得推廣。它的優(yōu)劣主要看植入的有益微生物種類和數(shù)量。

在這里也提醒大家注意，菌肥和多效有機肥不宜長時間存放，要避免高溫、水浸，一般也不能和殺菌劑混用。